個人綜合所得稅結算申報期間，以自然人憑證透過財政部網路報稅程式（請先至財政部電子申報繳稅服務網站，http://tax.nat.gov.tw，下載並安裝網路報稅軟體）除可下載所得資料外，另外還可下載包含保險費、購屋借款利息、教育學費、捐贈、醫藥及生育費、災害損失及身心障礙等共7項扣除額資料。
本（101）年財政部為了簡化綜合所得稅結算申報作業，提供稅額試算服務措施，如果收到財政部寄送的綜合所得稅稅額試算通知書，不論是繳稅案件採委託取款、退稅或不繳不退案件，都可使用自然人憑證線上(網站http://tax.nat.gov.tw)登入後，填寫繳退稅資料或確認後，即完成報稅。
內政部為方便民眾申辦自然人憑證及鼓勵民眾使用自然人憑證申報個人綜合所得稅，本（101）年網路報稅期間（自5月1日起至5月31日止）於內政部資訊中心設置申辦窗口、於全國加設17個臨時申辦地點，另各直轄、縣市戶政事務所配合於午休、夜間及假日受理民眾申辦服務等各項資訊請參考憑證管理中心網站（http://moica.nat.gov.tw）最新消息公告。
本（101）年5月份自然人憑證網路報稅抽獎活動：
內政部：從4月9日開始至5月31日止舉辦一系列活動，包括：新申辦用戶的「申辦好運龍總來」、展期用戶的「展期幸運抽好禮」、分享用戶的「輕鬆分享您最讚」及自然人憑證報稅用戶的「龍心大悅報稅抽」等，獎項豐富有禮券及雷射印表機等（詳細活動方式請查詢憑證管理中心網站http://moica.nat.gov.tw）。
財政部各區國稅局：為鼓勵民眾踴躍使用自然人憑證網路報稅，舉辦憑證網路報稅抽獎活動，獎項豐富，相關抽獎活動訊息請洽各區國稅局網站。